在生物質能的開發(fā)中，政府的導向和行業(yè)的管理有著舉足輕重的作用。甘蔗是夏威夷州的一種主要農作物。在制糖過程中，將甘蔗中的糖汁壓榨出來后會留下大量的甘蔗廢料(甘蔗渣)。甘蔗渣所含有的生物質能可作為燃料發(fā)電。在州政府的補貼下，當?shù)亟⒘艘慌紵收嵩陌l(fā)電廠。隨之而來，是環(huán)保方的抗議活動促使砍伐被迫中斷。巴西則經歷了因發(fā)展生物燃料項目而對生物多樣性帶來的更大的負面影響。同樣是在1980年代，因1970年代末期的高油價，巴西發(fā)起了一個用甘蔗生產乙醇的項目。當時政府補貼這種生產，但是1980年代末期糖價上漲，生產成本提高很多，直到1990年代末期這個項目又重新啟動，并且迅速獲得了市場滲透。大量的土地被用來種植甘蔗以應對快速增長的需求，這也導致亞馬遜(濕潤森林)和塞拉多(干旱森林)的一些熱帶森林被大量砍伐。為生產生物燃料而大量砍伐森林，是巴西生物燃料大量擴張的主要特點。無獨有偶，為了生物燃料，印度尼西亞和馬來西亞在熱帶森林清林而種植油棕櫚，這是該地區(qū)毀林的主要源頭。大規(guī)模轉向生物燃料會加速這些負面效應，并可能傳播到其他地區(qū)，例如中非。在夏威夷和巴西的實踐經驗表明，先進的能源政策導致替代能源供應有了預期增長，但市場壓力卻對自然系統(tǒng)帶來了意想不到的破壞作用，而且預期生物燃料等可再生能源在形成規(guī)模后會對生物多樣性造成更加嚴重的影響。
替代能源及其空間分布的平衡是決定對生物多樣性影響的關鍵因素，因此了解每種能源的這種影響及其空間適宜性至關重要。與便利開采自然過程儲存在地下的石油和天然氣不同，任何可再生能源都需要利用土地來轉化能量。本質上講，石油和天然氣是化石態(tài)的生物燃料，其需求土地的生產過程發(fā)生在過去。通常我們所考慮的石油和天然氣生產對環(huán)境和土地利用的影響僅指其開采和運輸方面的影響。因此，替代能源在土地利用和生物多樣性方面有著更大的潛在影響。
